如果你的U盘中含有exe病毒文件，首先需要注意的是不要直接在计算机上打开这些文件，以免感染病毒。对于恢复这些被病毒影响的文件，你可以尝试以下方法：

1. 使用杀毒软件：及时更新你的杀毒软件，并对U盘进行全盘扫描。一些杀毒软件可以检测和清除U盘中的病毒，并尝试恢复被病毒修改或删除的文件。

2. 手动检查并恢复文件：如果杀毒软件无法恢复文件，你可以尝试手动查找和恢复文件。有些病毒会修改文件的扩展名，将它们从正常的格式（如.doc或.jpg）更改为.exe。检查U盘中的所有文件，将它们恢复到原来的格式并尝试打开。请注意，这仅适用于文件未被病毒删除或加密的情况。

3. 使用数据恢复软件：如果文件已被病毒删除或加密，你可以尝试使用数据恢复软件来找回这些文件。请注意选择专业的数据恢复软件，并遵循软件的使用指南进行操作。这种方法的成功率取决于病毒感染系统的时间长短和恢复软件的性能。

4. 格式化U盘：如果以上方法都无法恢复文件，并且你的U盘不再需要保留其他数据，你可以选择格式化U盘以彻底清除病毒。但是，格式化将删除U盘上的所有数据，所以请确保你已经备份了需要保留的文件。

在任何情况下，都应该注意保持计算机和U盘的防护，定期更新杀毒软件和操作系统，避免在不安全的网站上下载文件或访问未知来源的链接。如果不确定如何处理U盘中的文件，最好不要直接打开它们，而是先将它们复制到计算机上，并使用杀毒软件进行检查。