修改12306注册时填写的手机号码，可以通过以下步骤进行：

1. 打开铁路12306应用，进入主页面后点击下方“我的”。

2. 点击“修改手机号”。

3. 进入“更换手机号码”页面后，输入新的手机号码和原手机收到的验证码。验证通过后，即可完成手机号码的修改。

如果有其他特殊情况，如原手机已注销或无法接收验证码，可以按照以下步骤操作：

1. 进入铁路客服中心新页面的最下面找到“账号安全”并点击跳转。进入新的页面后点击“修改注册手机号码”。随后进入验证界面进行身份验证。可以选择人脸识别或者手机验证等方式进行身份验证。验证通过后，即可修改注册时的手机号码。

请注意，具体的操作步骤可能会因为铁路系统的更新或调整而有所变化。如有任何疑问或需要帮助，建议直接联系铁路客服以获得最准确的指导。